به گزارش جهان، ایرج فاضل که در دولت اول رفسنجانی وزیر بهداشت بود، به دلیل ضعف عملکرد از سوی مجلس سوم استیضاح و برکنار شد.

وی در دوران فتنه با نگارش نامه ای توهین آمیز و نسبت دادن اتهاماتی علیه نظام از قبیل حمله وحشیانه، بیدادگری، گستاخی، بی ادبی و... خواستار  آزادی زندانیان و عذرخواهی نظام! شده بود.
وی بدون بیان حتی یک دلیل و مدرک، در ظلمی آشکار علیه نظامی که پای جمهوریت و رای مردم ایستاده بود، می نویسد: "چرا کار ما به اینجا کشید که در کمتر از سه دهه سوگوارانه شاهد ریخته شدن خون جوانان معصوم و بی‌گناهمان باشیم؟ چرا دانشجویان عزیز و دختران و پسران پاک اندیش و نگران ما باید بی‌دلیل مورد حمله وحشیانه قرار گرفته و راهی سیاه چالها شوند؟"

اقدامات افراطی دکتر فاضل به حدی بود که باعث شد از فرهنگستان علوم پزشکی برکنار و دکتر علیرضا مرندی جایگزین وی شود.

در حکم دکتر سیدحسن هاشمی وزیر بهداشت برای انتصاب دکتر ایرج فاضل آمده است: 
استاد ارجمند جناب آقای دکتر ایرج فاضل
 با سلام و احترام
 به استناد بند ب ماده 8 قانون سازمان نظام پزشکی جمهوری اسلامی ایران و با عنایت به تعهد، شایستگی و تجارب ارزشمند آن استاد فرهیخته و گرانقدر به موجب این ابلاغ به عنوان نماینده وزیر در شورای عالی نظام پزشکی منصوب می شوید.
 
امید است با عنایت خداوند متعال و با بهره مندی از ظرفیت های جامعه پزشکی کشور و تعامل سازنده با سازمان نظام پزشکی در جهت تحقق بخشیدن به ارزشهای اخلاقی و علمی در کلیه امور پزشکی و حمایت از حقوق بیماران و دست اندرکاران نظام سلامت موفق باشید.